Nabi Yunus yang kecewa dan marah kepada penduduk Ninawa yang keras kepala untuk menyembah berhala dan tak percaya Allah pun akhirnya berencana pergi meninggalkan daerah itu.
Sebelum pergi, Nabi Yunus berdoa kepada Allah meminta bencana diturunkan bagi penduduk Ninawa karena mereka terus membangkang.
Rupanya, Allah mendengar doa Nabi Yunus dan mengabulkannya. Namun, Nabi Yunus tidak mengetahui jika doanya dikabulkan karena ia sudah pergi meninggalkan penduduk Ninawa sebelum bencana itu datang.
Setelah Nabi Yunus pergi, langit pun tiba-tiba menjadi gelap gulita. Kemudian, muncul badai angin kencang yang menyapu Ninawa.
Pohon-pohon pun tumbang dan batu-batu terlempar. Penduduk Ninawa langsung ketakutan dengan bencana tersebut.
Mereka akhirnya bertobat dan memohon ampun kepada Allah SWT. Allah yang mendengar doa mereka pun akhirnya menghentikan bencana tersebut.
2. Selamat setelah berhari-hari di dalam perut ikan paus
Mukjizat Nabi Yunus selanjutnya muncul ketika ia telah meninggalkan Ninawa. Ternyata Nabi Yunus pergi tanpa izin Allah.
Hal ini membuat Allah memberi ujian kepada Nabi Yunus. Ketika menaiki sebuah kapal, datanglah gelombang besar yang dapat menenggelamkan kapal.