Tiga warna bertahan lama hingga 1969, ketika Gunung Iya dekat Ende meletus, dan sejak itu danau-danau Kelimutu secara berkala suka berganti warna.
Kadang warnanya biru-hijau, hitam, dan merah. Beberapa dua puluh tahun sebelumnya warna: biru muda, merah tua, dan hijau-menyala.
Taman Nasional Kelimutu juga menyimpan berbagai jenis burung cantik yang tercatat hampir punah.
Selain itu, flora di Taman Nasional Kelimutu sama-sama mengasyikkan seperti taman nasional lainnya, meski tidak luas, tetapi keindahan dan keunikan menjadi daya tarik utama dan sayang untuk di lewatkan.
Tarif masuk kawasan Taman Nasional Kelimutu bagi pengunjung domestik akan dikenakan tarif sebesar 5.000 rupiah dan 150.000 rupiah untuk pengunjung mancanegara.
Dan untuk biaya tambahan parkir kendaraan, untuk motor dikenakan 5.000 rupiah sedangkan untuk mobil dikenakan tarif 10.000 rupiah. *